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Forum de chimie - scienceamusante.net
Forum de chimie

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Peut encore comprendre... [67627]

ECOLAMI

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1321 messages postés


Posté le : 02/09/2009, 20:16 (Lu 34331 fois)

Commentaire :  quand c'est un si long nom


Bonjour,
Je lis cette formule d'antibiotique
(1S,2R,18R,19R,22S,25R,28R,40S)- 48- {[(2S,3R,4S,5S,6R)- 3- {[(2S,4S,5S,6S)- 4- amino- 5- hydroxy- 4,6- dimethyloxan- 2- yl]oxy}- 4,5- dihydroxy- 6- (hydroxymethyl)oxan- 2- yl]oxy}- 22- (carbamoylmethyl)- 5,15- dichloro- 2,18,32,35,37- pentahydroxy- 19- [(2R)- 4- methyl- 2- (methylamino)pentanamido]- 20,23,26,42,44- pentaoxo- 7,13- dioxa- 21,24,27,41,43- pentaazaoctacyclo[26.14.2.23,6.214,17.18,12.129,33.010,25.034,39]pentaconta- 3,5,8(48),9,11,14,16,29(45),30,32,34,36,38,46,49- pentadecaene- 40- carboxylic acid

Vraiment je ne vois pas trop qui saurait reconstruire la formule développée!


Tri+traitement Produits chimiques 77 (Seine et Marne)

Re: Peut encore comprendre... [67629]

nobelios

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1214 messages postés


Posté le : 02/09/2009, 21:54 (Lu 34328 fois)

Moi je vois ! Un logiciel comme chemskeatch qui fait ça par calcul !

Re: Peut encore comprendre... [67630]

darrigan
Modérateur

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2872 messages postés


Posté le : 02/09/2009, 21:59 (Lu 34325 fois)

Tu nous mets au défi ?

Re: Peut encore comprendre... [67632]

EXCHIM

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6 messages postés


Posté le : 02/09/2009, 22:38 (Lu 34322 fois)

Bonsoir,

Deja, c'est un nom Americain; enfin anglosaxon!

Re: Peut encore comprendre...

alexchimiste

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1196 messages postés


Posté le : 02/09/2009, 23:11 (Lu 34318 fois)

Merci EXCHIM, on ne l'aurait nous même pas déterminé...
Les produits chimiques n'ont pas de nationalité hein !
Et puis tu sais, la nomenclature internationale est en anglais... pas en espéranto.

Re: Peut encore comprendre... [67640]

nobelios

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1214 messages postés


Posté le : 03/09/2009, 12:19 (Lu 34300 fois)

Si justement, MEK et MEC par exemple qui sont les mêmes produits avec deux appellations différentes ! C'est malheureux mais c'est le cas aussi dans la prononciation, ainsi cétone sera keton, azote sera nitrogen, etc etc. Donc après certe la nomenclature IUPAC propose le même schéma mais selon le pays on met acide avant ou après (en UK et en US on ajoute acid à la fin). C'est vite déroutant. Pour cela il est préférable selon moi d'apprendre les formulations smiles qui peuvent être différentes pour nommer un produit mais où l'interprétation reste la même et répond à une règle. L'IUPAC est selon moi une formulation ORALE et SMILES est une formulation LITTÉRAIRE.

Cela dit même pour le défit je pense que c'est une molécule trop tirée par les cheveux pour perdre du temps à la nommer ou la dessiner. Mais c'est vrais que sur les boites de médicament une formule SMILES ce sera plus simple !

Re: Peut encore comprendre... [67635]

darrigan
Modérateur

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2872 messages postés


Posté le : 03/09/2009, 02:12 (Lu 34312 fois)

Voici par exemple la formule de l'érythromycine :



Vu comme ça n'a pas l'air trop compliqué : quelques fonctions alcool, cétone, étheroxyde, quelques groupes méthyles ou amine.
Mais si on veut être précis, il faut donner la configuration des carbones asymétriques. Or presque tous sont asymétriques ! La galère !

Voilà un bon exercice à donner aux étudiants :
- mettre une étoile sur tous les carbones asymétriques
- donner leur configuration R ou S
- indiquer les carbones pseudo-asymétriques (s'il y en a)
- combien y a-t-il de formes chirales possibles ?
- prévoir le spectre RMN


Re: Peut encore comprendre... [67783]

nobelios

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1214 messages postés


Posté le : 09/09/2009, 16:47 (Lu 34203 fois)

ohhhhhh, déjà que deux carbones asymétriques c'est chiants, trouver la RS c'est chiant. C'est pas compliqué c'est chiant !

Re: Peut encore comprendre... [67763]

Duke of Portland
Modérateur

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955 messages postés


Posté le : 08/09/2009, 22:15 (Lu 34229 fois)

En tout cas bravo Ecolami si tu as eu le courage de taper les 4 lignes du nom de la molécule ! (si c'est du copier-coller c'est trop facile !)

Re: Peut encore comprendre... [67771]

ECOLAMI

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1321 messages postés


Posté le : 09/09/2009, 08:25 (Lu 34219 fois)

Citation : Duke of Portland
En tout cas bravo Ecolami si tu as eu le courage de taper les 4 lignes du nom de la molécule ! (si c'est du copier-coller c'est trop facile !)

Bonjour,
Non j'ai juste copié-collé un nom d'antibiotique sur wikipédia, un macrolide bien plus complexe que l'érythromycine.
D'ailleurs je vous ai fait grâce de sa biosynthèse qui est expliquée en détails: un vrai morceau de bravoure!


Tri+traitement Produits chimiques 77 (Seine et Marne)

Re: Peut encore comprendre... [67772]

darrigan
Modérateur

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2872 messages postés


Posté le : 09/09/2009, 08:40 (Lu 34217 fois)

Juste pour m'amuser (!) je suis en train de décrypter ce nom systématique pour en dessiner la molécule C'est prise de tête, mais c'est possible ! Réponse plus tard. Si quelqu'un veut s'y mettre, on pourra comparer

Re: Peut encore comprendre... [67784]

nobelios

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1214 messages postés


Posté le : 09/09/2009, 16:48 (Lu 34199 fois)

Peut être un jour si j'ai le temps, mais faire un petit document avec des jeux du genre avec plusieurs difficultés c'est une bonne idée !

Re: Peut encore comprendre... [67777]

milamber
Modérateur

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1257 messages postés


Posté le : 09/09/2009, 11:20 (Lu 34212 fois)

Ne compte pas sur moi...
La molécule est assez jolie à regarder et à synthétiser mais retrouver sa structure à partir du nom n'est pas chose aisée...
Et encore Ecolami, t'as pas choisi la plus complexe des structures de la famille...

Milamber.

Re: Peut encore comprendre... [67789]

ECOLAMI

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1321 messages postés


Posté le : 09/09/2009, 19:03 (Lu 34191 fois)

Bonsoir,
Sur Wikipédia anglais la formule est donnée en texte et en image mais pas en notations smile ou autres.
Pour éviter la je donne la solution: VANCOMYCINE
D'ailleurs j'aurai été bien incapable de retrouver la formule à partir du nom!
(et vice-versa...)



Tri+traitement Produits chimiques 77 (Seine et Marne)

Re: Peut encore comprendre... [67807]

darrigan
Modérateur

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2872 messages postés


Posté le : 09/09/2009, 22:17 (Lu 34160 fois)

Haaaa oui en effet

Re: Peut encore comprendre... [67798]

nobelios

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1214 messages postés


Posté le : 09/09/2009, 20:26 (Lu 34177 fois)

C'est surtout le grand nombre de C asymétrique qui est vraisemblablement dingue !

Re: Peut encore comprendre... [67955]

Duke of Portland
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955 messages postés


Posté le : 12/09/2009, 21:59 (Lu 34135 fois)

Heureusement qu'on donne quand même des surnoms aux grosses molécules ! Imaginez ce que ça donnerait pour des protéines par exemple : la formule brute de l'insuline étant C257H383N65O77S6 ! Bon courage pour la nommer en IUPAC !

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